Kao uobičajeni medij za filtriranje, filter papir je prikladan za širok raspon primjena. U laboratorijskim postavkama koristi se za filtraciju otopina-kao što je odvajanje krutih-tekućih smjesa ili uklanjanje čestica nečistoća-podržavajući i kvalitativnu analizu (npr. odvajanje taloga) i kvantitativnu analizu (npr. gravimetrijsko određivanje) kako bi se osigurala točnost podataka; također olakšava predtretman uzorka u biološkim eksperimentima, kao što je filtriranje medija za kulturu stanica i izolacija mikroorganizama, čime se održava čistoća uzorka.
U industrijskoj proizvodnji koristi se za filtraciju tekućina u preradi hrane-kao što je filtriranje voćnog soka i piva za uklanjanje pulpe i nečistoća i povećanje bistrine pića-i u kemijskoj proizvodnji za filtraciju otapala i oporavak katalizatora, sprječavajući da nečistoće ugroze učinkovitost reakcije ili kvalitetu proizvoda. U proizvodnji automobila, filtrira ulje za podmazivanje i gorivo, uklanja metalne strugotine i prašinu kako bi zaštitio komponente poput motora. U svakodnevnom životu služi kao komponenta u pročistačima zraka i filtrima klima uređaja, hvatajući prašinu u zraku, pelud i mirise-uzrokujući čestice da poboljšaju kvalitetu zraka u zatvorenom prostoru; također se koristi u pročišćivačima vode za pred-filtraciju, uklanjanje velikih nečistoća poput sedimenta i hrđe kako bi se zaštitile komponente filtracije nizvodno.
Osim toga, u medicinskom području koristi se u unutarnjim slojevima medicinskih maski i filtracijskim slojevima zaštitne odjeće za filtriranje mikroorganizama i kapljica u zraku, pružajući zaštitu zdravstvenim radnicima; njegova svestranost u različitim scenarijima čini ga temeljnim materijalom u području filtracije.
